Helixfold
Dobla una cadena de residuos sobre una cuadrícula para que las unidades hidrofóbicas se agrupen en un núcleo enterrado y reduzcan la energía hasta su mínimo demostrado.
Cómo jugar
Una proteína se modela como una cadena de residuos hidrofóbicos (H) y polares (P) sobre una retícula 2D. Los vecinos hidrofóbicos que quedan adyacentes sin estar enlazados reducen la energía. Tu objetivo es plegar la cadena para que los residuos H formen un núcleo compacto y alcances la energía óptima.
- Haz clic en un residuo para pivotar la cola de la cadena alrededor de él.
- Haz clic alternativo en el mismo residuo para pivotar en la dirección contraria.
- Usa el botón Girar para cambiar la dirección de pivote predeterminada (horaria o antihoraria).
- Alcanza la energía mínima demostrable de la cadena para resolver el rompecabezas.
Controles
- PC: haz clic en los residuos para pivotar, vuelve a hacer clic para invertir, activa o desactiva Girar y usa Reiniciar para enderezar la cadena.
- Móvil y tableta: toca los residuos para pivotar; está totalmente adaptado a controles táctiles.
Consejos y estrategia
- Cuenta los contactos H-H, no la forma: cada par hidrofóbico no enlazado que queda adyacente reduce la energía.
- Busca una masa compacta en lugar de un brazo largo; la superficie expuesta de los residuos H es energía desperdiciada.
- Si el plegamiento se atasca, reinicia e intenta formar primero el núcleo a partir del grupo más denso de residuos H.
Qué aprenderás
Helixfold se basa en el modelo clásico hidrofóbico-polar de retícula para el plegamiento de proteínas, convirtiendo la búsqueda de una conformación en un rompecabezas.
- Habilidades: bioquímica, plegamiento de proteínas, modelo HP y optimización.
- Ideal para: secundaria avanzada o universidad.
- Para padres y docentes: el modelo HP de plegamiento de proteínas.
Acerca de Helixfold
Helixfold se basa en el modelo clásico hidrofóbico-polar de retícula para el plegamiento de proteínas, y convierte la búsqueda de una conformación de energía mínima en un rompecabezas táctil. Es un juego original y gratuito para navegador con tres longitudes de cadena, reto diario y modo de práctica.
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