Entierra juntos los residuos que huyen del agua y observa cómo cae la energía.
Se te da una cadena de residuos, unos hidrófobos (H) y otros no. Pliégala sobre la cuadrícula para que los residuos hidrófobos se agrupen en un núcleo enterrado: cada par H-H no adyacente que acabe tocándose baja la energía de la estructura. Alcanza la energía más baja para resolverlo.
Protein Fold es un puzle de bioquímica basado en cómo las proteínas se pliegan alrededor de un núcleo hidrófobo, el principio que da forma a las proteínas.
Plegar una cadena de residuos hidrófobos y polares para que los hidrófobos se entierren en un núcleo, puntuando cada contacto H-H no adyacente, es el modelo reticular HP del plegamiento de proteínas.
Puntuar directamente los contactos enterrados es la simplificación original.
Es una simplificación drástica que conserva la física esencial. El efecto hidrofóbico (los grupos apolares se agregan porque así se maximiza la entropía del agua que los rodea) es la fuerza dominante que da forma a una proteína, así que un modelo que apenas contiene nada más sigue produciendo plegamientos reconociblemente proteicos.
Protein Fold es un puzle de bioquímica construido en torno a los modelos de plegamiento de proteínas con núcleo hidrófobo. Es un juego original y gratuito para el navegador hecho en casa para PlayPendium.